(1) Peptidau gwrthficrobaidd pryfed: Mae pryfed yn ffurfio'r grŵp mwyaf o organebau, ac mae nifer y peptidau gwrthficrobaidd y maent yn eu cynhyrchu yn aruthrol. Hyd yn hyn, mae dros 200 o fathau o beptidau gwrthficrobaidd pryfed wedi'u nodi ar draws wyth gorchymyn, gan gynnwys Lepidoptera, Diptera, Coleoptera, ac Odonata; yn nodedig, mae 40 o enynnau peptid gwrthficrobaidd wedi'u hynysu oddi wrth y pryf sidan (*Bombyx mori*) yn unig.
(2) Peptidau gwrthficrobaidd mamaliaid: Cafodd y peptid gwrthficrobaidd mamalaidd Cecropin P1 ei ynysu gyntaf o'r coluddyn bach o fochyn ym 1989. Ar hyn o bryd, mae o leiaf 18 math wedi'u hynysu o foch, 30 o ddefaid, a 30 o wartheg.
(3) Peptidau gwrthficrobaidd amffibiaid: Mae gan amffibiaid groen noeth sy'n cyflawni swyddogaethau lluosog. Mae eu secretiadau croen yn cynnwys amrywiaeth eang o beptidau bioactif gyda gweithgareddau biolegol amrywiol; mae gan y rhan fwyaf o'r rhain briodweddau gwrthficrobaidd. Gan gynrychioli ffurf hynafol ac effeithiol o amddiffyniad naturiol, fe'u dosberthir yn gyffredinol fel peptidau gwrthficrobaidd.
(4) Peptidau gwrthficrobaidd o bysgod, molysgiaid, a chramenogion: Pardaxin, peptid gweddillion 35-amino-asid-wedi'i ynysu o Moses sole (*Pardachirus marmoratus*) ym 1986, oedd y peptid gwrthficrobaidd cyntaf {-amino-asid-peptid gweddillion wedi'i ynysu oddi wrth Moses sole (*Pardachirus marmoratus*)) ym 1986, oedd y peptid gwrthficrobaidd cyntaf {{{}} wedi'i amddifadu o bysgodyn {{} wedi'i amddifadu, wedi'i atoleiddio â nodwedd peptid, wedi'i amddifadu). strwythur sy'n gallu athreiddedd pilen. Mae'n gweithredu fel niwrotocsin ïonig, ac mae cyfres o beptidau deilliadol wedi'u datblygu sy'n arddangos gweithgaredd gwrthficrobaidd cryfach-a gweithgaredd hemolytig is - na melittin.
(5) Peptidau gwrthficrobaidd planhigion: Mae planhigion hefyd yn cynhyrchu peptidau gwrthficrobaidd yn strwythurol debyg i'r amddiffyniadau a geir mewn pryfed a mamaliaid; gelwir y rhain yn amddiffynfeydd planhigion. Mae'r rhan fwyaf o beptidau gwrthficrobaidd planhigion yn hynod weithgar yn erbyn pathogenau planhigion, er bod rhai hefyd yn arddangos gwenwyndra tuag at facteria, ffyngau, burumau a chelloedd mamalaidd Gram-positif a Gram{{-negyddol. Thionins oedd y peptidau gwrthficrobaidd cyntaf i gael eu hynysu o blanhigion.
(6) Peptidau gwrthficrobaidd bacteriol: Fe'u gelwir hefyd yn bacteriocinau, mae'r rhain yn cynnwys peptidau cationig a niwtral ac yn cael eu secretu gan facteria Gram-positive a Gram-negyddol. Mae pedwar math o peptidau gwrthficrobaidd wedi'u nodi mewn bacteria: bacitracin, gramicidin S, polymyxin E, a nisin.